一応、書き込み方法を書いておきます。
準備
１）USB-BLASTERを用意する。
純正を用意できればベストですが、パチモンでも十分使えます。
参考まで→ http://sbeach.seesaa.net/article/443951365.html
２）QuartusII または Quartus Prime をインストールする。
Alteraのホームページから、もしくは雑誌の付録などからインストールして下さい。
Quartus Prime の場合、64bit環境が必要になるようです。
Webエディションという、無料で使用できるものがあるので、それで十分です。
バージョンは新しい方がいいですが、最新の必要はありません。
（うちのは、QuartusII 10.1 です）
３）USB-BLASTERを一度も使用した事がない場合は、USB-BLASTERを挿してドライバがインストールされるのを確認する。
（その後で抜いてください）
書き込み手順
・DE0の場合は、ボードのRUN/PROGをPROGにしておきます。
１）FPGAボードのASP端子にUSB-BLASTERを挿し込む。
２）FPGAボードの電源を入れる（外部から電源を供給する）。
３）USB-BLASTERをパソコンに挿す。
４）QuartusII/Quartus Primeを起動する。
５）メニューバーの Tools - Programmer を起動する。起動したら横に伸ばしておく。
Programmer のパネルで、左上の『Hardware Setup』を押し、USB-Blaster を選択する。
その右の『Mode』は、Active Serial Programming を選択する。
Active Serial Programming に、何か聞かれたら、Yes を押す（この設定を変えると、既に設定されているファイルが書き込めないけどいいですか？と言っている）
Add File... を押し、〜.pof を選ぶ。
その後、画面に追加されたファイルの右の方の項目で、Program/Configure、Verify、Blank-Check、の箇所にチェックを入れる。
準備が出来たら、Startを押します。右上のProgress 100%（Success)になれば完了です。
６）USB-BLASTERをパソコンから抜く。
７）FPGAボードの電源を落とす。
