４．P6でよく使用されている内部フォーマットについて
P6の場合、内蔵／外付ドライブや、外付ドライブの種類の違いなどがあるため、特殊なフォーマットが使われる事があまりありません。
よく使われているフォーマットは以下の通りです（P6の説明書に書かれているものです）。
1D：
トラック#0〜#39（片面使用で、シリンダ番号#0〜#39を使用）
１トラック＝セクタ#1〜#16の16セクタ
１セクタ＝256バイト
BASICでは、トラック#0〜#34しか扱えないようです。
1DD：
トラック#0〜#79（片面使用で、シリンダ番号#0〜#79を使用）
１トラック＝セクタ#1〜#16の16セクタ
１セクタ＝256バイト
2D：
トラック#0〜#79（両面使用で、シリンダ番号#0〜#39を使用）
１トラック＝セクタ#1〜#16の16セクタ
１セクタ＝256バイト
前述の通り、トラック#0セクタ#1は起動時に読み込まれて、その内容が実行されます。
また、BASICでは、以下のような割り当てがされています。
1D：
トラック#18セクタ# 1〜#12：ディレクトリ（ファイル名などが格納されている）
トラック#18セクタ#13 ：ID（属性）
トラック#18セクタ#14〜#16：FAT（クラスタの使用状態が格納されている）
1DD/2D：
トラック#37セクタ# 1〜#12：ディレクトリ
トラック#37セクタ#13 ：ID
トラック#37セクタ#14〜#16：FAT
それ以外の部分はユーザ領域として、ファイル本体が格納されます。
他のページでも説明されているので、そちらも参考にして下さい。
http://p6ers.net/hashi/floppy.html
http://www.geocities.jp/submarine600/ （←ここの『落ちつく』の記事の一部）
５．P6でよく使用されている拡張子とデータ構造について
P6のフロッピーデータをWindows上で扱う時のフォーマットの話です。
○ベタフォーマット（〜.dsk）：
いわゆるベタファイルです。
トラック#0セクタ#1〜16
トラック#1セクタ#1〜16
：
トラック#79セクタ#1〜16 （1Dの場合、トラック#39）
の順で、各セクタのデータ部分のみを連結したものです。
そのため、ファイルサイズは、
1D：256x16x40 = 163840バイト（0x28000バイト）
1DD/2D：256x16x80 = 327680バイト（0x50000バイト）
になります。
○P31フォーマット（〜.P31）：
SD6031/SD6031WIFで使用されているフォーマットです。
SDカードにアクセスする際に、簡単にアクセスできるように、１セクタ＝512バイトにしています。
0x00で埋めている部分は使用してませんので、実際には何でも構いません。
1DD/2D：
それぞれの１セクタ256バイトの後に、0x00を256バイト続けます。
トラック#0セクタ#1（256バイト）
0x00 ×256バイト
トラック#0セクタ#2（256バイト）
0x00 ×256バイト
：
トラック#79セクタ#16（256バイト）
0x00 ×256バイト
1D：
それぞれの１セクタ256バイトの後に、0x00を256バイト続けます。
さらに１トラックの後に、0x00を
(1DD/2Dで奇数トラックに当たる部分をベタ0x00にしています）
トラック#0セクタ#1（256バイト）
0x00 ×256バイト
トラック#0セクタ#2（256バイト）
0x00 ×256バイト
：
トラック#0セクタ#16（256バイト）
0x00 ×256バイト
0x00 ×
トラック#1セクタ#1（256バイト）
0x00 ×256バイト
：
トラック#1セクタ#16（256バイト）
0x00 ×256バイト
0x00 ×
：
トラック#39セクタ#16（256バイト）
0x00 ×256バイト
0x00 ×
ファイルサイズは、1D、1DD/2Dとも、655360バイト（0xa0000バイト）になります。
○D88フォーマット（〜.d88）：
業界(?)標準のフォーマットです。
元々、PC-8801用エミュレータのフォーマットのようです。
トラック数、セクタ数が固定ではないものを対応するために、ヘッダにそれぞれのトラック先頭の場所が書かれています。さらに、それぞれのセクタ先頭に、そのトラック内のセクタ数やCHRN（シリンダ番号、ヘッダ番号、セクタ番号、セクタ長）が書かれています。
標準的に使用されているため、実フロッピーとのやり取りなどのツールもあります。
詳しくは、他のページで説明されているので、そちらを参考にして下さい。
http://papicom.net/p6v/tech.html
http://www.geocities.jp/submarine600/ （←ここの『落ちつく』の記事の一部）
○それぞれの変換ツール
D88、P31相互変換
http://tulip-house.ddo.jp/digital/SD6031/index.html
D88、DSK相互変換
http://p6ers.net/bernie/develop/d88todsk.html
D88作成
http://www.geocities.jp/submarine600/ （←ここの『R&D』の『PC-6000 シリーズ用 D88 ディスクイメージ書き込みツール』）
また、拙作のPC-8801から変換するソフトの中に、d88todsk、d88todsk1dd、などがありますが、これはD88ファイルの任意のトラック、セクタからデータを抜き出すソフトです。
細々と需要がありそうなので、遅ればせながら d88tool に D88/P31/DSK の相互変換機能をつけてみました。
P31 はイメージサイズが全部同じなので 1D/1DD/2D の区別はなく、刺したイメージにあわせて手動で指定する感じなのでしょうか。
1D の場合のみハード側でトラック2倍、みたいな。
ついでに P31 の HDD イメージ取り扱い機能もおまけで付けました。
P6 側の入出力ルーチン書かないと意味ないですが。
P31/DSK は、1DD/2Dの区別はありません。
また、P31 では1D/1DD/2D の違いが無いので、P31→d88への変換は、実行時に指定する事になると思います。
変換ツールは作ろうと思って、そのままほったらかしていたので(^^;) 助かります。
P31 の HDDモードは、使っている人が皆無かもしれませんが(^^;)